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登Nature子刊!華中科技大學(xué)提出融合策略AI模型,實現(xiàn)多中心、跨??聘腥拘孕菘怂劳鲲L(fēng)險的精準(zhǔn)預(yù)測

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感染性休克(又稱膿毒性休克)是指由膿毒癥引發(fā)的嚴(yán)重循環(huán)障礙和細(xì)胞代謝紊亂的綜合征,在臨床表現(xiàn)上可以視為膿毒癥發(fā)展的「終末階段」。感染性休克具有極高的病死率,也是目前重癥監(jiān)護(hù)病房最致命的疾病之一。根據(jù)一項基于英國國家級重癥監(jiān)護(hù)數(shù)據(jù)庫的研究報告顯示,感染性休克患者的住院死亡率可高達(dá) 55.5% 。

面對這一高致死率的進(jìn)展性疾病,臨床中針對感染性休克強(qiáng)調(diào)「時間就是生命」,提倡早發(fā)現(xiàn)、早干預(yù)、早治療,從而來降低病死率。然而,由于感染性休克患者病情復(fù)雜,臨床醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)稀少,導(dǎo)致針對感染性休克患者病情進(jìn)展的早期預(yù)警變得十分困難,這也是有效干預(yù)膿毒癥向感染性休克惡化的關(guān)鍵瓶頸。

目前,隨著重癥醫(yī)學(xué)信息化程度加深, 人工智能 與重癥醫(yī)學(xué)的交叉融合已經(jīng)讓膿毒癥早期預(yù)警不再困難,但針對感染性休克的研究卻遲滯不前。這是因為多數(shù)研究樣本數(shù)量稀少,依賴于單一的機(jī)器學(xué)習(xí) 算法 ,同時又未能通過多中心驗證,導(dǎo)致它們遲遲難以推廣至感染性休克患者早期風(fēng)險預(yù)測的臨床實踐當(dāng)中。

有鑒于此,華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院附屬同濟(jì)醫(yī)院葉慶教授、醫(yī)藥衛(wèi)生管理學(xué)院吳紅教授團(tuán)隊,開創(chuàng)性地提出了一個基于 TOPSIS(Technique for Order Preference by Similarity to an Ideal Solution)的分類融合(TCF)模型,用于預(yù)測 ICU 中感染性休克患者 28 天內(nèi)的死亡風(fēng)險。該模型整合了 7 種機(jī)器學(xué)習(xí)模型,在跨專業(yè)、多中心驗證中具有較高的穩(wěn)定性和準(zhǔn)確性,為臨床醫(yī)生提供了一個值得信賴的感染性休克死亡風(fēng)險早期預(yù)警的輔助工具。

研究成果以「Artificial intelligence based multispecialty mortality prediction models for septic shock in a multicenter retrospective study」為題,發(fā)表于 Nature 子刊 npj digital medicine 。

研究亮點:

* 研究采用高效的融合策略,構(gòu)建了一個基于多基本分類模型的高泛化能力和魯棒性的融合模型,克服了小樣本隊列和單一分類模型在臨床場景中性能不佳的問題

* 研究成果突破了感染性休克早期死亡風(fēng)險預(yù)測難的問題,為臨床醫(yī)生提供了一個高效、穩(wěn)定、可靠的臨床決策工具,有助于醫(yī)生更早地密切監(jiān)測患者的病情進(jìn)展,并采取更積極的治療措施

數(shù)據(jù)集:廣泛數(shù)據(jù),精確處理

為了構(gòu)建具有廣泛適用性的感染性休克預(yù)測模型,研究團(tuán)隊整合了 3 家醫(yī)院自 2003 年 2 月到 2023 年 11 月間,共計 4,872 名 ICU 感染性休克患者的臨床數(shù)據(jù),其參與者背景復(fù)雜多樣,有助于研究團(tuán)隊開展多中心、跨專科驗證,以證明模型的有效性和適用性。如下圖所示:


研究樣本隊列及劃分

具體來說,cohort 1 共計包含了 4,189 名參與者,其中普通 ICU 患者 3,451 名(721 名陽性,2,730 名陰性);兒科 ICU 患者(cohort 1-1)有 357 名(52 名陽性);呼吸 ICU 患者(cohort 1-2)有 381 名(60 名陽性)。
* 陽性結(jié)果為在 ICU 住院 28 天內(nèi)經(jīng)歷全因死亡的參與者,未經(jīng)歷全因死亡的參與者被標(biāo)記為陰性結(jié)果(下同)

其中,普通 ICU 患者數(shù)據(jù)集作為主要研究人群并用于模型構(gòu)建和內(nèi)部驗證,訓(xùn)練數(shù)據(jù)和驗證數(shù)據(jù)按照 8:2 劃分,分別為 2,760 名(577 名陽性)和 691 名(144 名陽性)。兒科 ICU 患者和呼吸 ICU 患者數(shù)據(jù)集則進(jìn)一步評估了模型在不同??浦匕Y監(jiān)護(hù)病房的適用性和穩(wěn)定性。

cohort 2 和 cohort 3 包含了不同 ICU 的感染性休克患者,分別有 422 名參與者(100 名陽性,322 名陰性)和 261 名參與者(75 名陽性,186 名陰性)。這兩部分?jǐn)?shù)據(jù)集主要用于進(jìn)行外部驗證,以評估其在不同中心的泛化能力和有效性。

另外,為了精確實驗結(jié)果,研究團(tuán)隊提取了 93 項常規(guī)的臨床 特征 ,包括人口統(tǒng)計學(xué)信息、疾病及治療史、生命體征信息等,最終優(yōu)化到 34 項用于實驗。

具體來看, 數(shù)據(jù)預(yù)處理 共包含 5 個部分:第一步,研究團(tuán)隊首先通過缺失率計算,刪除了缺失率高于 30% 的 23 項變量;第二步,根據(jù)伯努利方差公式(Bernoulli’s variance formula)計算布爾特征(Boolean Features)的方差,再次移除一致性超 90% 的離散隨機(jī)變量;第三步,通過缺失值插值方法(Logistic 回歸 多重插補)進(jìn)一步優(yōu)化至 61 項變量;第四步,再次進(jìn)行高相關(guān)性特征篩選(Pearson 相關(guān)系數(shù) ≥0.7),此時還剩 50 個變量。如下圖所示:


特征處理流程

第五步,研究人員根據(jù) 信息熵 排序(由高到低),最終選擇出了用于實驗的 34 項關(guān)鍵變量,包含了年齡、手術(shù)史、體溫、舒張壓等重要因素。


基于信息熵排序,當(dāng)變量數(shù)為 34 時最優(yōu),此后 AUC 不再隨變量數(shù)量增加獲得增益

需要說明的是,為了保護(hù)參與者隱私,所有數(shù)據(jù)在分析之前已做了去標(biāo)識化處理。

模型架構(gòu):融合模型,精準(zhǔn)預(yù)測

TCF 模型的研究主要分為 3 個步驟:第一步是利用感染性休克患者的住院數(shù)據(jù)建立 7 個子模型, 每個子模型產(chǎn)生 6 個評估指標(biāo)的結(jié)果;第二步基于融合策略,將子模型整合為一個融合模型,并驗證該模型優(yōu)于其他模型;第三步涉及跨各種數(shù)據(jù)集測試以驗證模型的性能,并對模型進(jìn)行 可解釋性 分析(實驗結(jié)果部分說明)。


基于電子健康記錄系統(tǒng)建立預(yù)測模型的過程說明

具體來看,第一步,研究團(tuán)隊首先使用經(jīng)過特征處理后普通 ICU 數(shù)據(jù)集訓(xùn)練并測試 7 個子模型,根據(jù) 1:1 規(guī)則對訓(xùn)練集應(yīng)用 Synthetic Minority Over-sampling Technique(SMOTE),以減輕類不平衡的負(fù)面影響,之后經(jīng)過最小-最大 歸一化 后,通過五重交叉驗證和隨機(jī)搜索確定最優(yōu)參數(shù)組合,并在訓(xùn)練集上訓(xùn)練 7 個子模型,分別是 Decision Tree(DT),Random Forest(RF),XGBoost(XGB),LightGBM(LGBM),Naive Bayes(NB),Support Vector Machine(SVM)和 Gradient Boosted Decision Tree(GBDT)。

最后,研究團(tuán)隊又使用內(nèi)部驗證數(shù)據(jù)對測試結(jié)果進(jìn)行驗證,并通過 6 個評估指標(biāo)對模型的性能進(jìn)行評估,分別為 area under ROC curve(AUC),F(xiàn)1-score,precision(PRE),accuracy(ACC),sensitivity(SEN)和 specificity(SPE)。

第二步,研究團(tuán)隊整合了這 7 個各有優(yōu)缺點的子模型,設(shè)計了一個基于 TOPSIS 的分類融合模型 TCF,將 7 個模型的評估結(jié)果結(jié)合起來,為感染性休克的診斷提供一個綜合的預(yù)測結(jié)果。子模型的 權(quán)重 由 TOPSIS-score 計算,加權(quán)后的預(yù)測概率即為 TCF 的預(yù)測概率,以 0.5 為臨界值推導(dǎo)出 TCF 的分類結(jié)果。

具體 TCF 模型的融合算法如下:

其中 j 表示預(yù)測樣本,P 表示預(yù)測陽性結(jié)果的概率

統(tǒng)計分析方面,對于連續(xù)特征,給出中位數(shù)、上四分位數(shù)和下四分位數(shù)的統(tǒng)計數(shù)據(jù);對于離散特征,報告每個類別的比例。在本次研究中,最小的數(shù)據(jù)集是隊列 3,根據(jù)中心極限定理,連續(xù)特征的均值分布可以認(rèn)為是正態(tài)分布。

然后,研究采用 Levene 檢驗來確定兩組數(shù)據(jù)之間特征的同質(zhì)性,采用 Chi-square 檢驗比較其他數(shù)據(jù)與內(nèi)部驗證集的離散特征差異,連續(xù)特征差異采用獨立樣本 t-test 檢驗或 Welch’s t-test 檢驗,使用 1,000 個 bootstrap 樣本計算評估指標(biāo)的 95% 置信區(qū)間。

為了更深入理解模型的推理過程,研究團(tuán)隊還通過繪制 SHAP 特征重要性熱圖將其特征重要性進(jìn)行可視化處理。以 AUC 性能最好的 GBDT 模型為例,如下圖所示:


GBDT 子模型 SHAP 特征重要性熱圖

特征重要性排序不僅可以提高臨床預(yù)測模型的透明度和可信度,還能為醫(yī)療實踐提供有價值的參考。如此一來,模型即滿足了醫(yī)生對模型透明度的需求,同時也量化了臨床凈收益,實現(xiàn)了臨床可解釋性與實用性并重,為模型在臨床實踐中得到應(yīng)用奠定了基礎(chǔ)。

實驗結(jié)果:多維驗證,可靠易用

為了驗證融合模型(TCF)的性能,研究團(tuán)隊首先將其與子模型進(jìn)行了比較,結(jié)果如下圖所示:


TCF 在內(nèi)部驗證集上的 2 個綜合評價指標(biāo)上均優(yōu)于子模型,AUC 為 0.733,F(xiàn)1-score 為 0.458 。此外,ACC 為 0.686 和 PRE 為 0.358 也高于多數(shù)子模型。這顯示出其具有出色的分類能力。


TCF 模型與子模型在內(nèi)部驗證集上的 ROC 曲線軌跡和 AUC 值

雖然 TCF 模型在 SEN 和 SPE 上的得分都沒有達(dá)到最佳性能,分別是 0.640 和 0.700,但它可以通過整個子模型的偏差識別效果,從而獲得最佳的整體性能。如下圖所示。


內(nèi)部驗證集上所有模型的曲線 校準(zhǔn) 圖

TCF 模型在內(nèi)部驗證集上的 DCA 結(jié)果

校準(zhǔn)曲線 和 Decision Curve Analysis(DCA)曲線表明了 TCF 模型的預(yù)測結(jié)果與實際結(jié)果一致。首先,TCF 模型的校準(zhǔn)曲線最接近對角線,這表明它在所有模型中具有最佳的校準(zhǔn)性能;其次,TCF 模型的曲線在大多數(shù) 閾值 概率下始終優(yōu)于「All」和「None」策略,尤其在 0.1 到 0.5 的概率范圍內(nèi)展現(xiàn)出更高的凈收益。這表明 TCF 模型在一定范圍內(nèi)具有潛在的臨床應(yīng)用價值,可以幫助臨床醫(yī)生做出更有利的決策。

隨后研究團(tuán)隊進(jìn)行了多中心驗證,該驗證可以更準(zhǔn)確地展示 TCF 模型的預(yù)測性能,以及不同數(shù)據(jù)集之間存在的異質(zhì)性。如下圖所示:

多中心驗證的 ROC 曲線對比

可見,與大多數(shù)研究中多中心預(yù)測效果略低于訓(xùn)練集和內(nèi)部驗證集的預(yù)測效果不同,在本次研究中,除 cohort 1-2(呼吸 ICU 患者數(shù)據(jù)集)的 AUC(0.662)略有下降外,cohort 1-1(兒科 ICU 患者數(shù)據(jù)集)、 cohort 2 和 cohort 3 的 AUC 均有改善,分別為 0.808 、 0.784 和 0.786 。

另外,由于多中心樣本數(shù)量有限,研究團(tuán)隊特別結(jié)合 4 個外部驗證數(shù)據(jù)集進(jìn)行預(yù)測(1,421 例患者數(shù)據(jù),含 287 例陽性),其 AUC 為 0.7705,這表明了 TCF 模型能夠有效區(qū)分感染性休克低危險因素的患者,具有良好的校準(zhǔn)能力。


所有數(shù)據(jù)集上 6 個指標(biāo)的表現(xiàn)

其中,a 為 AUC 箱線圖;b 為 ACC 箱線圖;c 為 SPE 箱線圖;d 為 F1-score 箱線圖;e 為 PRE 箱線圖;f 為 SEN 箱線圖?;疑摼€表示內(nèi)部驗證集的結(jié)果,其他數(shù)據(jù)集的評估分?jǐn)?shù)落在深灰色區(qū)域內(nèi),表明與內(nèi)部驗證集相比性能下降。

總而言之,TCF 模型在內(nèi)部數(shù)據(jù)集和外部驗證集上均取得了一致且良好的性能, 在預(yù)測感染性休克患者 28 天內(nèi)死亡風(fēng)險方面顯示出優(yōu)于單個模型的表現(xiàn)。該模型為 ICU 臨床醫(yī)生提供了一個可靠且易用的預(yù)測工具,尤其在患者病情惡化的關(guān)鍵早期,可以有效幫助醫(yī)生針對不同患者提供有效、個性化的治療干預(yù),改善患者預(yù)后。

人工智能在膿毒癥/感染性休克治療中大展身手

隨著科技的不斷發(fā)展,人工智能與重癥醫(yī)學(xué)的交叉融合早已成為相關(guān)研究人員高度關(guān)注的領(lǐng)域,本次研究無疑是其中具有開創(chuàng)性價值的一次探索。正如前文提到,膿毒癥/感染性休克作為一種具有高死亡率和發(fā)病率的全球性公共衛(wèi)生危機(jī),亟需通過早期發(fā)現(xiàn)和干預(yù)來提高患者的生存率。

在過去,針對膿毒癥早期預(yù)警模型的研究早已花開蒂落,不少實驗室都提出了相關(guān)研究成果。

比如美國杜克大學(xué) Armando D Bedoya 等人發(fā)表的題為「Machine learning for early detection of sepsis: an internal and temporal validation study」的研究,其中介紹并驗證了一種基于 深度學(xué)習(xí) (多輸出高斯過程和 遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò) )的預(yù)測模型 MGP-RNN,在與包括 random forest 、 Cox regression 和 penalized logistic regression 在內(nèi)的 3 種機(jī)器學(xué)習(xí)方法,以及 3 種臨床評分的比較中,該模型在各項指標(biāo)上均優(yōu)于其他模型和臨床評分,可提前 5 小時檢測膿毒癥。

除此之外,美國加利福尼亞州一家名為 Dascena 公司的團(tuán)隊也在一篇研究中給出他們的見解,他們采用回顧性研究方法,使用 MIMIC II 臨床數(shù)據(jù)庫中 32,000 名患者的數(shù)據(jù),通過 9 種常見生命體征測量之間的相關(guān)系,開發(fā)了一種名為 InSight 的膿毒癥早期預(yù)警算法。結(jié)果顯示,該算法在持續(xù) Systemic Inflammatory Response Syndrome(SIRS)發(fā)作前 3 小時預(yù)測膿毒癥的靈敏度達(dá)到 0.90,特異性為 0.81,表現(xiàn)超過了現(xiàn)有生物標(biāo)志物檢測方法。研究以「A computational approach to early sepsis detection」為題發(fā)表。

人工智能與重癥醫(yī)學(xué)的融合讓膿毒癥的早期預(yù)警不再困難,而本次研究無疑是填補了膿毒癥發(fā)展到危重階段無法及時預(yù)警的空白,是一次更具醫(yī)學(xué)價值的探索。當(dāng)然,更重要的是本次研究所提到的融合性策略,通過平衡子模型的靈敏度和特異性優(yōu)勢,從而提升整個模型的綜合性能,這為后續(xù)通過多模型集成解決相關(guān)問題鋪墊了道路,啟發(fā)了更多研究通過類似方法解決醫(yī)療場景中的實際困難。

評論
孫首華
少傅級
2025-06-06
科普知識之窗
太師級
了解一下感染性休克
2025-05-31
科普636c5296
庶吉士級
感染性休克(又稱膿毒性休克)是指由膿毒癥引發(fā)的嚴(yán)重循環(huán)障礙和細(xì)胞代謝紊亂的綜合征,在臨床表現(xiàn)上可以視為膿毒癥發(fā)展的「終末階段」。感染性休克具有極高的病死率,也是目前重癥監(jiān)護(hù)病房最致命的疾病之一。根據(jù)一項基于英國國家級重癥監(jiān)護(hù)數(shù)據(jù)庫的研究報告顯示,感染性休克患者的住院死亡率可高達(dá) 55.5% 。
2025-05-29