死亡似乎是一種純粹的失去,但如果我們將視角放大到細(xì)胞層面,死亡便呈現(xiàn)出不同且更為微妙的意義。單單定義什么才使一個(gè)細(xì)胞“存活”或“死亡”,就是一個(gè)挑戰(zhàn)。
今天,科學(xué)家們正致力于理解細(xì)胞消失的各種方式和原因,以及這些過程對(duì)生物系統(tǒng)意味著什么。細(xì)胞生物學(xué)家沙伊·沙哈姆(Shai Shaham)與播客主持人斯蒂芬·斯托加茨(Steven Strogatz)討論了細(xì)胞死亡的不同形式、它們?cè)谶M(jìn)化和疾病中的作用,以及為什么正確的細(xì)胞死亡類型和模式對(duì)我們的發(fā)展和健康至關(guān)重要。在你播放本期節(jié)目的這一秒鐘里,你體內(nèi)有100萬個(gè)細(xì)胞死亡。其中一些細(xì)胞是通過自然調(diào)控的過程,比如凋亡(apoptosis),被程序性地終止生命;有些細(xì)胞則是在感染后主動(dòng)結(jié)束自己的生命,防止病毒入侵進(jìn)一步擴(kuò)散;還有一些細(xì)胞因物理損傷經(jīng)歷壞死(necrosis),細(xì)胞膜破裂,內(nèi)容物泄露出來。我們知道,細(xì)胞有近十幾種不同的死亡方式。而學(xué)會(huì)如何控制這些過程,對(duì)病人來說可能會(huì)帶來天壤之別的影響。
小鼠脂肪前驅(qū)細(xì)胞(preadipocytes)凋亡。? wikimedia
斯托加茨:我非常好奇關(guān)于細(xì)胞死亡的更多信息。所以我想我們也許可以從細(xì)胞的生命開始談起。細(xì)胞有哪些表現(xiàn)能讓我們判斷它是活的呢?
沙哈姆:這個(gè)問題其實(shí)相當(dāng)復(fù)雜。這真的取決于你用什么樣的標(biāo)準(zhǔn)或測(cè)定方法來判斷細(xì)胞是活著還是死亡的。例如,如果一個(gè)細(xì)胞正在移動(dòng),我們可能會(huì)說它是活的。但如果細(xì)胞靜止不動(dòng),你就要問:什么才意味著活著?它是在代謝食物嗎?還是在向其他細(xì)胞傳遞信號(hào)? 不過,也有人認(rèn)為,這類活動(dòng)同樣可以出現(xiàn)在一些化學(xué)上活躍但卻沒有執(zhí)行任何生物學(xué)功能的細(xì)胞中。在細(xì)胞死亡研究領(lǐng)域中,如何定義“死亡的細(xì)胞”是一個(gè)長期困擾我們的難題。而至少對(duì)我來說,我最認(rèn)可的定義是:如果一個(gè)細(xì)胞徹底消失了,那它就是死了。除此之外,很難做出判斷。
斯:有趣的是,這個(gè)問題竟如此微妙。很多人都認(rèn)為細(xì)胞是通過分裂來維持生命的。我想知道,細(xì)胞分裂是否是活著的一個(gè)關(guān)鍵特征?細(xì)胞必須分裂才能被認(rèn)為是活的嗎?
沙:如果一個(gè)細(xì)胞正在分裂,那么它顯然是活的。但問題在于,如果它不分裂,它就一定是死的嗎?對(duì)此,答案依然取決于具體的情境。例如,某些細(xì)菌孢子可以在數(shù)年內(nèi)不進(jìn)行分裂,但當(dāng)時(shí)機(jī)合適時(shí),它們會(huì)從孢子狀態(tài)中蘇醒過來,重新開始分裂和繁殖。所以,在這段可能長達(dá)數(shù)十年的時(shí)間里,這個(gè)細(xì)胞是死的還是活的呢?
? Heiti Paves/SPL/Science Source
這里有一個(gè)我非常喜歡的例子,因?yàn)槲覀儗?shí)驗(yàn)室研究秀麗隱桿線蟲(C. elegans)。最近有人從西伯利亞的永凍土中提取出一條線蟲,它在大約4萬年前被凍住,而后在實(shí)驗(yàn)室中被重新喚醒[1]。因此,你不禁會(huì)問:在這4萬年里,這個(gè)生物到底是死的還是活的呢?
斯:難以置信!這太有意思了。我們?cè)谌粘UZ言中有一個(gè)概念叫做“假死狀態(tài)”(suspended animation)。你提到的那些孢子,通俗地說,它們似乎是在等待“復(fù)活”。但當(dāng)它們處于這種假死狀態(tài)時(shí),它們的本質(zhì)是什么?這就引出了一個(gè)關(guān)于不可逆性的問題。
沙:是的,你現(xiàn)在正苦惱的問題也是我們這一領(lǐng)域長期以來的困擾。歸根結(jié)底,一切都取決于測(cè)定方法。比如,假設(shè)有一個(gè)孢子,它等待了100年才開始分裂。如果你在第30年觀察它,并花幾周時(shí)間檢測(cè)它的活動(dòng),那么從任何標(biāo)準(zhǔn)來看,它都是死的。只有等到100年后,它重新復(fù)活時(shí),你才會(huì)說:啊,原來它是活著的。 不過,如果我們換一個(gè)標(biāo)準(zhǔn),比如檢測(cè)它的代謝活動(dòng)、基因組中突變的積累,或者它向其他細(xì)胞發(fā)出的信號(hào),只要它在你的測(cè)試中表現(xiàn)出“活動(dòng)”,你就會(huì)認(rèn)為它是活的。但這只是一個(gè)操作性定義。我認(rèn)為,沒有必要在這個(gè)問題上引入神秘主義的元素。
斯:你說得很清楚,我們可以通過一些操作性定義來判斷細(xì)胞是否存活。這種方法相對(duì)客觀,比如檢測(cè)它是否在代謝、是否在分裂等。為了更好地界定生與死,我想引入一些新的角度,比如細(xì)胞的某些部分。細(xì)胞的一部分是否也可以“死亡”?還是說,死亡必須發(fā)生在整個(gè)細(xì)胞上?
沙:當(dāng)然可以。如果你還記得我之前提到的,我最認(rèn)可的“死亡細(xì)胞”的定義是:當(dāng)細(xì)胞完全消失時(shí),它才算是死了。但確實(shí)存在細(xì)胞的某些部分消失的情況。這可以是程序性事件(正常的生物過程),也可能是由于受傷或其他意外造成的。
? Cell Press
例如,在動(dòng)物發(fā)育過程中,神經(jīng)軸突(axons)會(huì)從神經(jīng)元中伸展出來。軸突是從神經(jīng)元伸出的細(xì)長突起,其功能是與其他神經(jīng)元連接,從而使大腦正常工作。在正常發(fā)育過程中,某些軸突可能會(huì)開始回縮,這種回縮現(xiàn)象被稱為“逆行死亡”(dying back)[2]。從功能上看,這種回縮的軸突已經(jīng)喪失了功能,而且它們確實(shí)正在消失。因此,你可以說,細(xì)胞的一部分正在“死亡”。
斯:那么,你提到了程序性細(xì)胞死亡,這是我接下來想了解的一個(gè)主題。我讀到過一種叫做“壞死”的細(xì)胞死亡方式。當(dāng)一個(gè)細(xì)胞發(fā)生壞死時(shí),會(huì)發(fā)生什么?
沙:在這里,讓我區(qū)分兩種不同的細(xì)胞死亡方式。一種是由基因程序決定的細(xì)胞死亡,它是存在于細(xì)胞DNA中的一套特定基因,專門用來引導(dǎo)細(xì)胞走向死亡。這一過程是由進(jìn)化選擇并傳遞給細(xì)胞后代的,目的是讓細(xì)胞自我終結(jié)。 另一種死亡方式,則類似于當(dāng)你踩到細(xì)胞時(shí)發(fā)生的情況。可以想象,有無數(shù)種非自然方式會(huì)損害細(xì)胞,而壞死就是其中之一。壞死是一個(gè)定義比較模糊的術(shù)語,但人們通常將其描述為一種非調(diào)控的細(xì)胞死亡方式,這種死亡不受基因控制,通常表現(xiàn)為細(xì)胞腫脹、細(xì)胞膜形成異常結(jié)構(gòu),最終細(xì)胞內(nèi)容物泄漏到周圍環(huán)境中。
斯:我猜這會(huì)引發(fā)免疫系統(tǒng)的反應(yīng)吧?
沙:是的,一般來說,基因程序性死亡和外力導(dǎo)致的細(xì)胞死亡之間的區(qū)別在于,前者是設(shè)計(jì)得非常“干凈”的,目的是在死亡時(shí)盡可能不擾亂周圍環(huán)境。事實(shí)上,這種死亡過程會(huì)盡一切努力將對(duì)周圍細(xì)胞的損害降到最低。 但另一種死亡類型通常會(huì)引發(fā)強(qiáng)烈反應(yīng),不論是來自鄰近細(xì)胞,還是如果動(dòng)物具有免疫系統(tǒng)的話,免疫細(xì)胞也會(huì)試圖應(yīng)對(duì)爆裂細(xì)胞對(duì)周圍環(huán)境造成的損害。
斯:我之前提到“凋亡”這個(gè)詞,也就是這種相對(duì)“干凈”的程序化死亡方式。我說得對(duì)嗎?我們現(xiàn)在談的就是這個(gè)嗎?
沙:我想說,研究這個(gè)領(lǐng)域的人通常會(huì)將程序型細(xì)胞死亡等同于凋亡,但實(shí)際上這并不完全準(zhǔn)確。凋亡只是程序性細(xì)胞死亡的一種形式。我們自己的實(shí)驗(yàn)室發(fā)現(xiàn)了一種不同的細(xì)胞死亡方式,稱為“連接細(xì)胞型死亡”(linker cell–type death),簡稱LCD[3]。另外,還有至少一種我知道的細(xì)胞死亡形式,是我的同事在果蠅中研究的。所以,我們目前知道的真正意義上的基因程序化細(xì)胞死亡途徑有三種。
斯:你能為我們描繪一下它們的樣子嗎?當(dāng)一個(gè)細(xì)胞經(jīng)歷這三種死亡中的任何一種時(shí),我們應(yīng)該如何想象?
沙:關(guān)于“凋亡”,這個(gè)術(shù)語實(shí)際上是約翰·F·R·科爾和安德魯·懷利在20世紀(jì)70年代早期的一篇論文中首次提出的(該詞源于希臘語,意為樹葉從樹上脫落,以此來形容一種死亡過程)。它的特點(diǎn)是核內(nèi)DNA或染色質(zhì)會(huì)凝聚,變得非常緊湊,無法繼續(xù)執(zhí)行功能。 此外,細(xì)胞質(zhì)(即細(xì)胞的大部分)會(huì)收縮。通常,細(xì)胞質(zhì)中的線粒體等細(xì)胞器會(huì)破裂,但這通常發(fā)生在死亡過程的后期??傮w來說,整個(gè)過程非常迅速。只有當(dāng)你坐在那里計(jì)數(shù)經(jīng)歷這種過程的細(xì)胞數(shù)量時(shí),你才會(huì)意識(shí)到這種死亡方式是多么普遍。
? 京都大學(xué)
因此,這是一種非常緊湊的分解過程,細(xì)胞會(huì)被清理掉。這些死亡細(xì)胞的表面會(huì)出現(xiàn)特殊信號(hào),稱為“吞噬我”(eat me)信號(hào),這會(huì)向鄰近細(xì)胞或?qū)B毻淌杉?xì)胞發(fā)出信號(hào),讓它們過來吞噬并分解這些死亡細(xì)胞。大多數(shù)程序性細(xì)胞死亡都遵循這一路徑,而凋亡具有我剛才提到的這些特征。 而連接細(xì)胞型死亡在某種程度上幾乎是凋亡的“鏡像”。在這種死亡過程中,染色質(zhì)凝聚很少發(fā)生。事實(shí)上,這種細(xì)胞死亡的標(biāo)志是染色質(zhì)非常松散。此外,細(xì)胞器并不像凋亡那樣等到死亡過程的后期才表現(xiàn)出缺陷,而是從一開始就傾向于腫脹。但重要的是,這種細(xì)胞死亡的表面仍會(huì)呈現(xiàn)“吞噬我”信號(hào),這些細(xì)胞仍會(huì)被鄰近細(xì)胞或?qū)B毻淌杉?xì)胞清理掉并降解。
斯:關(guān)于這種第二種細(xì)胞死亡,我很感興趣。首先,我從未聽說過它,其次,我職業(yè)生涯中的第一篇科學(xué)論文是關(guān)于染色質(zhì)纖維結(jié)構(gòu)的數(shù)學(xué)建模。所以當(dāng)你提到“連接”(linker)時(shí),你指的是核小體之間的連接DNA嗎?
沙:實(shí)際上不是。我們是在秀麗隱桿線蟲中發(fā)現(xiàn)這種細(xì)胞死亡的。這是發(fā)生在雄性線蟲中的一個(gè)單一細(xì)胞的死亡,稱為連接細(xì)胞(linker cell)。之所以稱為“連接細(xì)胞”,是因?yàn)樗鼘l(fā)育中的雄性生殖腺與精子釋放通道連接起來。這一細(xì)胞相當(dāng)于一個(gè)“塞子”,位于生殖管與出口通道之間。動(dòng)物通過這一新的連接細(xì)胞型死亡程序來消除它,從而使這兩個(gè)通道融合在一起,讓精子得以釋放。
? Cell Press
通過電子顯微鏡,我們觀察到這種細(xì)胞死亡的特征——它不僅僅局限于秀麗隱桿線蟲中的這一細(xì)胞,也在哺乳動(dòng)物和人類的發(fā)育過程中非常常見。事實(shí)上,我們神經(jīng)系統(tǒng)中發(fā)生的許多細(xì)胞死亡就具有這種特征。此外,連接細(xì)胞型死亡還有一個(gè)顯著特征:細(xì)胞核膜會(huì)出現(xiàn)凹陷,我們稱之為“鋸齒結(jié)構(gòu)”(crenellations),呈現(xiàn)波浪狀外形。這也是許多人類疾病中細(xì)胞死亡的標(biāo)志。我們非常好奇,連接細(xì)胞型死亡在某些人類疾病中是否發(fā)揮了作用,比如在病理狀態(tài)下,這種細(xì)胞死亡被錯(cuò)誤地激活。
斯:我想回到細(xì)胞死亡與人類疾病之間的關(guān)系。但如果可以的話,我想繼續(xù)討論與防御功能相關(guān)的幾種細(xì)胞死亡途徑,比如在病毒或其他病原體引起感染時(shí),細(xì)胞死亡作為對(duì)攻擊的反應(yīng)而發(fā)生的情況。
沙:許多這種情況與凋亡有很多共同之處,而它們的命名通常是基于具體的情境。比如,“焦亡”(pyroptosis)是一種發(fā)生在炎癥反應(yīng)中的凋亡型細(xì)胞死亡?!敖埂保╬yro)指的是與炎癥或這種“熾熱”狀態(tài)有關(guān)的概念。
中性粒細(xì)胞吞噬炭疽桿菌(橘黃色)。? Cell Press
其基本原理是,當(dāng)細(xì)胞感染了病毒或細(xì)菌時(shí),為了宿主生物體的利益,細(xì)胞選擇自我消亡,以免病毒或細(xì)菌擴(kuò)散到整個(gè)機(jī)體。除了凋亡型細(xì)胞死亡,還有許多針對(duì)受感染細(xì)胞的途徑。比如,細(xì)胞毒性T細(xì)胞在識(shí)別出被病毒感染的細(xì)胞后,會(huì)釋放名為穿孔素(perforins)的蛋白。這些蛋白的名字正如其字面意義,它們?cè)诎屑?xì)胞膜上打出孔洞,進(jìn)而觸發(fā)凋亡反應(yīng),或者導(dǎo)致細(xì)胞內(nèi)容物泄漏,最終細(xì)胞解體并被循環(huán)中的吞噬細(xì)胞清理掉。類似的情況還發(fā)生在補(bǔ)體介導(dǎo)的細(xì)胞死亡中,這是機(jī)體對(duì)被病原體入侵的細(xì)胞所采取的另一種反應(yīng)。通常,這是一種非常復(fù)雜的蛋白級(jí)聯(lián)反應(yīng)(cascade),最終導(dǎo)致被感染細(xì)胞被一種蛋白質(zhì)覆蓋,而這種蛋白質(zhì)起到了“吞噬我”的標(biāo)記作用。與其他例子不同,這種情況下,細(xì)胞本身并未從內(nèi)部被破壞,而是被標(biāo)記為“有害”,以便吞噬細(xì)胞將其清除。
斯:從這些討論中,我的印象是,細(xì)胞在執(zhí)行這些程序或允許自己被標(biāo)記為“吞噬我”時(shí),都是為了“集體利益”。這是為了幫助周圍的細(xì)胞或組織。這似乎是多細(xì)胞生物特有的現(xiàn)象。如果是單細(xì)胞生物,可能就不會(huì)有這樣的動(dòng)力去做這些事。這些過程是在多細(xì)胞生物的背景下發(fā)生的。我的理解對(duì)嗎?
沙:你的想法基本正確,但我不會(huì)將其僅僅局限于多細(xì)胞生物。只要細(xì)胞群體處于一種需要相互依賴才能存活的環(huán)境中,這一原則就適用。所以,在多細(xì)胞生物中,個(gè)體細(xì)胞必須遵循“我可能需要為了集體利益而犧牲”的原則,但在細(xì)菌中也是如此。比如,細(xì)菌傾向于形成所謂的生物薄膜(biofilms),即許多細(xì)菌排列成片。在饑餓條件下,當(dāng)生物薄膜無法提供足夠的食物時(shí),部分細(xì)菌會(huì)選擇自我毀滅,以便為其他存活下來的細(xì)菌提供營養(yǎng)。這一原則在細(xì)胞集合中都適用,不論是在單個(gè)多細(xì)胞生物內(nèi)部,還是更廣泛的多細(xì)胞環(huán)境中。
斯:所以,我們可以廣義地理解為“多細(xì)胞性”,不一定局限于單個(gè)多細(xì)胞生物,而是包括各種形式的多細(xì)胞生命。沙:在動(dòng)物的背景下,我們可以找到這一原則的重要例子。例如,在螞蟻群體中,其本質(zhì)上被稱為“超級(jí)有機(jī)體”,每只螞蟻在群體中都扮演重要角色。常常,螞蟻需要犧牲自己來創(chuàng)造對(duì)群體生存至關(guān)重要的結(jié)構(gòu),甚至提供食物。
? The Conversation
有一些令人驚嘆的視頻可以在YouTube或《國家地理》上找到,展示了螞蟻搭建橋梁的場(chǎng)景,讓其他螞蟻可以通過。而作為橋梁的螞蟻往往會(huì)死亡,它們的外骨骼成為橋梁的一部分,讓其他螞蟻能夠行走。這種個(gè)體動(dòng)物為了整體利益犧牲自己的例子十分常見。
斯:這很有趣。我還想問你,因?yàn)槟闾岬竭^秀麗隱桿線蟲,這種只有約一毫米長的小蟲在生物學(xué)各領(lǐng)域中都教會(huì)了我們?cè)S多知識(shí),包括發(fā)育、遺傳學(xué)、行為學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)和衰老。我們從這種小生物中學(xué)到了令人難以置信的東西??赡苡行┞牨妼?duì)它還不熟悉,你能否簡單介紹一下秀麗隱桿線蟲,以及它如何幫助我們理解細(xì)胞死亡過程及其重要性?
沙:當(dāng)然。如果你想研究細(xì)胞死亡,了解某一時(shí)刻、某一特定位置的細(xì)胞會(huì)死亡是很有幫助的。因?yàn)檫@種可預(yù)測(cè)性可以讓你提前操控系統(tǒng),提出各種問題。而在大多數(shù)模型系統(tǒng)中,這種可預(yù)測(cè)性是不存在的。 不過,線蟲,特別是在秀麗隱桿線蟲中,我們可以做到這一點(diǎn)。秀麗隱桿線蟲有一個(gè)顯著特性,即從受精卵到成蟲的細(xì)胞分裂模式在同一種群的個(gè)體間幾乎完全相同,只有少量例外。同時(shí),細(xì)胞死亡模式也完全相同。我們通過為線蟲的細(xì)胞命名來證明這種模式的一致性。我們可以說這個(gè)細(xì)胞叫“莫伊”,那個(gè)叫“科利”(當(dāng)然,我們實(shí)際上給它們起的名字要無趣得多,比如ASE、NSM或CEP sheath)。而在我們或其他脊椎動(dòng)物中,你無法給細(xì)胞命名并在每個(gè)個(gè)體中找到相同的細(xì)胞。我們可以精確地告訴你,一個(gè)叫“科利”的細(xì)胞會(huì)在受精卵分裂開始后4小時(shí)20分鐘死亡,死亡過程將持續(xù)25分鐘。這些細(xì)節(jié)是在20世紀(jì)70年代末和80年代初由兩位杰出的科學(xué)家鮑勃·霍維茨(Bob Horvitz)和約翰·蘇爾斯頓(John Sulston)確定的[4]。他們繪制了從受精卵到成蟲的完整細(xì)胞分裂模式。在觀察這些分裂展開時(shí),他們注意到一些細(xì)胞最終會(huì)消失,而這些就是死亡的細(xì)胞。
? Carolina Biological
因此,我們知道,例如在發(fā)育中的秀麗隱桿線蟲雌雄同體中,會(huì)生成1090個(gè)體細(xì)胞,其中有131個(gè)會(huì)死亡,最終形成959個(gè)體細(xì)胞。基于這種精確性,我們可以進(jìn)行各種遺傳學(xué)和細(xì)胞生物學(xué)研究,反復(fù)觀察同一個(gè)細(xì)胞,嘗試?yán)斫怛?qū)動(dòng)細(xì)胞死亡的原因。我認(rèn)為這是使用秀麗隱桿線蟲研究細(xì)胞死亡的最大優(yōu)勢(shì)。
斯:所以,如果有人好奇的話,它們并不難捕捉,對(duì)吧?就像是,你隨便抓一把泥土,就會(huì)有很多這種秀麗隱桿線蟲在里面?
沙:秀麗隱桿線蟲這種線蟲廣泛分布于全世界。事實(shí)上,當(dāng)我剛開始在洛克菲勒大學(xué)的實(shí)驗(yàn)室工作時(shí),我第一個(gè)想法就是試圖找到“洛克菲勒版本”的秀麗隱桿線蟲。我到外面取了一些土壤樣本,把它們放在裝有瓊脂的培養(yǎng)皿上(這是我們培養(yǎng)線蟲的方法),等待它們出現(xiàn)。果然,我們找到了它們。我當(dāng)時(shí)非常興奮,因?yàn)檎业搅恕奥蹇朔评瞻姹尽钡木€蟲,但后來發(fā)現(xiàn),洛克菲勒大學(xué)的土壤其實(shí)是從紐約州北部進(jìn)口的。所以這些線蟲其實(shí)并不是真正的“本地線蟲”,而是來自紐約州北部。
斯:哈哈,像是“鄉(xiāng)下線蟲”搬到了“城市”里。你剛剛講述的故事非常引人入勝,秀麗隱桿線蟲從受精卵到成蟲的發(fā)展過程簡直像機(jī)器一樣精準(zhǔn)。你提到這種現(xiàn)象在人類或其他復(fù)雜生物中并不具有同樣的可預(yù)測(cè)性。我相信有些人可能會(huì)有疑問:這種特殊的線蟲是否在整個(gè)生物界中獨(dú)一無二?請(qǐng)說服我們,研究這種奇怪的線蟲對(duì)我們真的有意義。
沙:首先,我應(yīng)該說,它們確實(shí)很特別。它們能夠完成的某些事情是其他生物做不到的。這一點(diǎn)不能被忽略。但如果從與其他動(dòng)物的相關(guān)性來看,只需觀察它們的DNA序列和基因組就能看出[5]。秀麗隱桿線蟲的DNA序列、基因組與我們的幾乎相同。 例如,細(xì)胞凋亡過程由一種名為caspase的蛋白質(zhì)執(zhí)行。這種蛋白質(zhì)的功能是切割其他蛋白質(zhì),這個(gè)蛋白質(zhì)由一個(gè)基因編碼,而這個(gè)基因在秀麗隱桿線蟲和人類中幾乎是相同的。要是套用尼采的觀點(diǎn),“人是蟲”(Man is worm),或許更貼切。
斯:我對(duì)這個(gè)引用不太熟悉。這是尼采的原話嗎?
沙:是的,用德語表達(dá)的,但這是翻譯過來的版本。
斯:沒想到他竟然是個(gè)細(xì)胞生物學(xué)家(笑),也許他確實(shí)洞察到了什么。接下來,我想探討一下研究細(xì)胞死亡的各種實(shí)驗(yàn)系統(tǒng),從培養(yǎng)皿中的細(xì)菌到秀麗隱桿線蟲,再到更復(fù)雜的生物體。我們研究細(xì)胞死亡問題的最佳規(guī)模是什么?
沙:我認(rèn)為,從不同的規(guī)模層次入手都非常重要。最小的層次是單個(gè)細(xì)胞。細(xì)菌中的細(xì)胞死亡非常重要,不僅關(guān)系到健康問題,也能解答一些基礎(chǔ)的科學(xué)好奇心:比如一個(gè)細(xì)菌如何決定自己需要死亡?在細(xì)菌中研究這個(gè)問題非常有意義。 在細(xì)胞培養(yǎng)中研究也能告訴我們很多東西。例如,如果我們從人類或小鼠身上提取細(xì)胞,將其放入培養(yǎng)基中,讓它們分裂或死亡,我們可能無法了解它們執(zhí)行死亡程序的上下文。但我們能夠?qū)W到很多關(guān)于分子機(jī)制和信號(hào)通路的知識(shí),弄清楚哪些信號(hào)會(huì)告訴細(xì)胞“該死了”或者“不該死”。一旦在這種簡化的細(xì)胞培養(yǎng)模型中建立了一些原則,我們就可以嘗試將這些理解擴(kuò)展到生物體中。例如,探索一個(gè)在細(xì)胞培養(yǎng)中發(fā)現(xiàn)的基因,在生物體中可能對(duì)細(xì)胞產(chǎn)生什么影響。 在生物體層面,還有一些只有在這個(gè)背景下才能探索的問題,比如細(xì)胞死亡的群體現(xiàn)象。不只是單個(gè)細(xì)胞的死亡,而是細(xì)胞群的集體行為。在發(fā)育生物學(xué)領(lǐng)域,這方面的研究最為精彩,特別是涉及形態(tài)生成的過程。形態(tài)生成是多細(xì)胞生物如何形成其特定形狀的過程。 雕塑家羅丹曾說過,他試圖揭示隱藏在石塊中的雕像(編者注:這句話也可能是米開朗基羅說的)。細(xì)胞死亡也是類似的原理:我們有一團(tuán)細(xì)胞,通過某些細(xì)胞的死亡形成特定的形狀。一個(gè)最著名的例子是脊椎動(dòng)物指頭和趾頭的形成。
斯:你是說手指或腳趾的形成?
? ResearchGate
沙:是的。比如在人類胚胎發(fā)育階段,所有脊椎動(dòng)物的胚胎都有非常明顯的手指間細(xì)胞連膜[6]。在我們這樣的脊椎動(dòng)物中,這些連膜的細(xì)胞會(huì)發(fā)生大量死亡,最終形成分開的手指。但在鴨子身上,大部分這種細(xì)胞死亡不會(huì)發(fā)生,所以它們有蹼。
斯:這真是太神奇了。并不是鴨子的蹼長出來了,而是其他動(dòng)物“切割”掉了蹼結(jié)構(gòu)!我還想知道是否存在一些遺傳變異?我的一些親戚常說:“看看我的腳趾,中間有蹼。”
沙:這些可能是殘留的結(jié)構(gòu),在胚胎發(fā)育過程中沒有完全被消除。
斯:回到與人類相關(guān)的話題,關(guān)于細(xì)胞死亡,這是否可以幫助我們逆轉(zhuǎn)器官衰竭或解決大量細(xì)胞死亡的問題?
沙:細(xì)胞死亡幾乎與人類所有疾病狀態(tài)相關(guān)。從廣義上講,這些問題可以分為兩類。一類是細(xì)胞死亡過多的疾病,如器官梗塞。例如,心臟病發(fā)作時(shí)心肌細(xì)胞的死亡,或者神經(jīng)退行性疾病,比如阿爾茨海默癥和帕金森癥,大腦中的細(xì)胞會(huì)死亡。另一類是本應(yīng)死亡的細(xì)胞沒有死亡,這就是幾乎所有癌癥的本質(zhì)問題。癌細(xì)胞中,某些程序停止工作,使得這些有害的細(xì)胞無法被正常清除,導(dǎo)致其不恰當(dāng)?shù)卮婊盍讼聛怼?/strong>
癌細(xì)胞的分裂增殖。? wikipedia
原則上,這些問題幾乎涉及所有主要疾病。盡管細(xì)胞死亡并不是每種疾病的根本原因,但有些情況下,如果我們能阻止細(xì)胞死亡,至少可以爭取一些時(shí)間治療那些本來會(huì)徹底消失的細(xì)胞。在應(yīng)用方面,已經(jīng)有一些藥物研究試圖在各種疾病背景下通過抑制或促進(jìn)細(xì)胞死亡來解決問題。例如,目前在臨床中有些藥物專門觸發(fā)腫瘤中特定細(xì)胞的死亡,而這些藥物的開發(fā)正是基于我們對(duì)細(xì)胞死亡機(jī)制和相關(guān)分子的理解。
斯:聽你之前提到細(xì)胞表面的“吞噬我”信號(hào),我不禁想到,這種機(jī)制能否應(yīng)用于癌癥免疫療法,或者類似的治療方法?
沙:目前還沒有專門針對(duì)“吞噬我”信號(hào)的臨床試驗(yàn),但我們可以人工制造這些信號(hào)。如果我們能發(fā)現(xiàn)癌細(xì)胞表面的一些獨(dú)特標(biāo)記,與其他正常細(xì)胞完全不同,就可以生成一種特定抗體來觸發(fā)癌細(xì)胞的凋亡。這樣可以精準(zhǔn)殺死癌細(xì)胞,而不損害身體的其他細(xì)胞。實(shí)際上,在癌癥治療領(lǐng)域正在進(jìn)行一場(chǎng)非凡的革命,被稱為免疫療法。這正是其基礎(chǔ)。其理念是讓身體識(shí)別腫瘤細(xì)胞的特定獨(dú)特標(biāo)記,生成針對(duì)這些標(biāo)記的免疫反應(yīng),然后免疫細(xì)胞會(huì)通過我們之前提到的多種方式去摧毀這些腫瘤細(xì)胞。
斯:我們花了很多時(shí)間關(guān)注過去幾十年里關(guān)于細(xì)胞死亡的發(fā)現(xiàn)。我想知道,您是否有一些希望在有生之年看到解答的問題,或者您認(rèn)為這個(gè)領(lǐng)域中還有哪些令人興奮的未解之謎?
沙:是的,我認(rèn)為我們還有許多需要研究學(xué)習(xí)的地方。正如你在對(duì)話開頭提到的,一個(gè)被廣泛研究的細(xì)胞死亡過程叫做凋亡。多年來,我們認(rèn)為這種過程足以解釋動(dòng)物發(fā)育期間發(fā)生的許多細(xì)胞死亡相關(guān)事件。 然而,在過去幾十年的研究中,我們發(fā)現(xiàn),可以完全從動(dòng)物的基因組中移除這個(gè)細(xì)胞死亡程序,而動(dòng)物仍然能夠正常生存。這意味著可能還有其他方式讓細(xì)胞死亡。一種方式可能是我提到過的連接細(xì)胞型死亡,但這可能并不是唯一的方式。因此,這個(gè)關(guān)于其他死亡程序的“黑箱”是一個(gè)非常有趣的方向,特別是如果我們希望將細(xì)胞死亡作為應(yīng)對(duì)疾病的重要角度。 另一個(gè)我們希望弄清楚的大問題是:我提到在秀麗隱桿線蟲中,我們確切知道哪個(gè)細(xì)胞在何時(shí)會(huì)死亡。而在脊椎動(dòng)物中,我們并不知道。如果有兩個(gè)相鄰的人類細(xì)胞,為什么一個(gè)會(huì)經(jīng)歷細(xì)胞死亡而另一個(gè)不會(huì)?我們對(duì)此完全不了解。所以我認(rèn)為這變成了一個(gè)更大的問題,涉及細(xì)胞如何響應(yīng)其環(huán)境。此時(shí)細(xì)胞死亡只是一個(gè)反應(yīng)的體現(xiàn),但它仍然是一個(gè)非常迷人的問題,目前完全沒有答案。
細(xì)胞生物學(xué)家沙伊·沙哈姆。? The Rockefeller University
斯:太棒了!這些方向非常令人振奮。最后,作為一個(gè)參與這項(xiàng)偉大事業(yè)的科學(xué)家,您的研究中是否有讓您特別感到快樂的地方?
沙:我熱愛發(fā)現(xiàn)新事物。我一直對(duì)發(fā)現(xiàn)別人未曾了解的新事物感興趣。從某種意義上說,我所發(fā)現(xiàn)的具體細(xì)節(jié)甚至不是那么重要。因?yàn)橐坏┥钊胙芯考?xì)節(jié),一切看起來都很有趣、令人興奮。只要有問題可以探討,并且我能想象出解決的方法,這就會(huì)每天激勵(lì)我去工作。而這種激情至今未曾消失。
斯:我很理解這種感覺。我有時(shí)會(huì)告訴我的研究生,這個(gè)問題是什么幾乎不重要,發(fā)現(xiàn)的過程本身就非常令人滿足。一旦深入研究,一切都會(huì)變得有趣。
沙:完全同意。這種感覺雖然少見,卻令人感到充實(shí)。
斯:弗朗西斯·克里克(Francis Crick)曾經(jīng)說過,與其研究一個(gè)瑣碎或無趣的問題,不如去研究一個(gè)重要的問題。這句話是否影響過您選擇的研究目標(biāo)?
沙:我經(jīng)常在決定下一個(gè)目標(biāo)時(shí)想到這句話。但老實(shí)說,我認(rèn)為自己不具備決定什么是重要、什么是不重要的傲慢??茖W(xué)一次次地證明了,那些看似不重要、邊緣化的發(fā)現(xiàn),往往在幾十年后變得炙手可熱。這可能在生物學(xué)、物理學(xué)或數(shù)學(xué)中都是如此。因此,如果我局限于克里克建議的這個(gè)框架,可能會(huì)排除掉一些比我想象中更令人興奮的發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域。我想,即使我的想象力已經(jīng)不錯(cuò),但也不足以預(yù)見未來的發(fā)展。
斯:您的回答讓我深受啟發(fā)。這種謙遜不僅是一種美德,從您描述的角度來看,它也可能是一種非常實(shí)際的態(tài)度。畢竟,我們真的無法預(yù)測(cè)未來。這次對(duì)話非常精彩,我都可以和您聊一整天了。
沙:謝謝你,斯蒂芬。我非常享受這次交流。
文/Steven Strogatz
譯/gross
校對(duì)/tamiya2
原文/www.quantamagazine.org/how-is-cell-death-essential-to-life-20241205/
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